Programi izvan redovitih studija, namijenjeni stjecanju i dopuni znanja — na Centru se izvodi Razlikovni program za upis na diplomski studij.
Cjeloživotno obrazovanje obuhvaća programe koji se izvode izvan redovitih studijskih programa, a služe stjecanju, obnavljanju ili proširivanju znanja i vještina. Na Sveučilištu u Zagrebu uređeno je Pravilnikom o cjeloživotnom obrazovanju, a na Centru vlastitim pravilnikom.
Na Sveučilišnom centru za protestantsku teologiju Matija Vlačić Ilirik trenutačno se izvodi jedan takav program.
